Vad är polyakrylamidgel?

Polyakrylamidgel är en lösning som vanligtvis används vid elektrofores, processen för att separera molekyler eller partiklar av olika storlekar genom att passera dem genom en gel och applicera elektrisk ström.Det finns olika recept för polyakrylamidgel, men den innehåller vanligtvis akrylamid, vatten, en buffert, ammoniumpersulfat (AP) och tetrametyletylendiamin (TEMED).Denna gel fungerar som en matris som separerar föreningar baserat på deras laddning och storlek;Ju mer akrylamid i gellösningen, desto bättre separering av mindre molekyler.Vanligtvis används denna gel för protein- och DNA -separering.

I elektrofores får ett elektriskt fält att laddade partiklar rör sig genom en gel, som fungerar som en sikt för att få de olika storlekarna att separera.Gelén kommer att absorbera all värme som produceras från den elektriska strömmen.Polyakrylamidgel används vanligtvis i denna procedur, men agaros, en annan kemikalie som skapar en liknande gel, kan också användas.

Geler kan vara gjorda av varierande koncentration, med mängden akrylamid som sträcker sig från cirka 6% till 15%.Vid blandning av gelén är akrylamiden opolymeriserad, vilket innebär att den förblir som enstaka molekyler.Tillsatsen av andra kemikalier som främjar bindning, såsom Temed, får molekylerna att koppla samman och bilda långa kedjor mdash;polydelen av polyakrylamid.

Den största fördelen med polyakrylamidgel är att antalet kopplingsbindningar och hårdhet kan kontrolleras baserat på den initiala mängden akrylamid och tillagd teman.En huvudfaktor i akrylamidkoncentrationen är storleken på molekylen som analyseras.Ju mindre föreningarna separeras, desto mer akrylamid behövs;Mycket små partiklar separeras med hjälp av den högsta koncentrationen, 15 procent.

Akrylamid fungerar genom att kontrollera mängden friktion i gelén;Gelens hårdhet bestämmer mängden friktion.Föreningar som är stora kommer att röra sig genom gelén långsammare eftersom det naturligtvis finns mer friktion eller motstånd på grund av deras storlek.Mindre föreningar rör sig snabbare, eftersom det finns mindre friktion.För att förhindra att små föreningar rör sig från gelén tillsätts mer akrylamid för att skapa mer friktion.

DNA -polyakrylamidgel används för att separera DNA -strängar av olika längd.DNA -bitar kommer att separeras med så lite som en nukleotid, föreningarna som utgör varje tråd.För att veta vilka bitar som hänvisar till de specifika storlekarna, körs en standard som innehåller fragment av en känd storlek vanligtvis tillsammans med prover.DNA -bitarna jämförs sedan med standarden och storleken på strängen bestäms.

En liknande procedur används för att bestämma storleken på proteiner, oftast de i blod.Blod innehåller två huvudtyper av protein: globulin, ett stort protein och serumalbumin, ett mycket litet, negativt laddat protein.Separation med användning av polyakrylamidgel används för att bestämma mängden av varje typ.