Skip to main content

Vad är en peptidsekvens?

Peptider är biologiska polymerer som bildas genom koppling av aminosyror, vars viktigaste element är kol (C), väte (H), syre (O) och kväve (N).Termen peptidsekvens hänvisar till den ordning i vilken aminosyror är kopplade.Peptider är mycket viktiga i levande system och kombineras för att bilda mycket större kedjor som kallas proteiner.Även om det finns många sorter av biologiska peptider, består de flesta av dessa av bara 20 aminosyror.Proteiner utför en rad biologiska funktioner, inklusive som enzymer och i strukturen av cellväggar i växter och membran i djurceller.

Aminosyror kallas så eftersom de har amin (-NH 2 ) och karboxylsyra (-CO-CO 2 H) grupper.De flesta aminosyror som finns i biologiska system har den allmänna formeln R-Ch (NH 2 ) -CO 2 H, där R är en rad grupper.Den varierande strukturen för R är det som påverkar strukturen och egenskaperna hos peptider och proteiner.

Peptidsyntes inträffar när en aminosyror amingrupp reagerar med karboxylsyragruppen på en annan aminosyra.Resultatet är bildningen av en amidgrupp av struktur -n (h) -Co- där kväve-till-kolbindningen kallas en peptidbindning.Primär proteinstruktur är i vilken ordning aminosyrorna finns;Detta är dess peptidsekvens.De funktionella grupperna på proteinet interagerar med varandra för att dra det i en form.De enskilda vridningarna av en peptid kallas dess sekundära struktur.Dess övergripande form, nettoresultatet av alla dessa vändningar, är peptiderna tertiärstruktur.

De biokemiska egenskaperna hos proteiner eller peptider beror på tertiär struktur.Som med alla kemikalier kommer proteiner att anta den mest energiskt gynnsamma formen.Denna form beror på attraktiva och avvisande krafter mellan grupperna på de enskilda aminosyrorna.Därför beror tertiär struktur på grund av primär struktur, vilket innebär att dra av peptidsekvensen för ett visst protein i slutändan kommer att förklara dess egenskaper.

Att utarbeta peptidsekvensen för ett protein har tillämpningar vid utformning av läkemedel.Många biologiska processer beror på proteinernas verkan, och läkemedel fungerar ofta genom att antingen kopiera eller blockera verkningen av dessa proteiner.Att förstå beteendet hos proteiner kan leda till utformning av effektivare läkemedel.Av denna anledning har forsknings- och utvecklingsavdelningen för ett läkemedelsföretag vanligtvis ett peptidbibliotek eller peptidkatalog som den kommer att använda i sökandet efter nya läkemedel.