Vad är en proteinligand?

En proteinligand binder till receptorplatser på ytan av ett protein.Ligander är involverade i en mängd olika processer, från proteinvikning till förändringsstruktur och de ger en funktion i immunreaktioner.De är ett ämne för nära studier i forskningsanläggningar, eftersom de spelar en viktig roll i hälsovårdsapplikationer.Skräddarsydda mediciner kan till exempel dra fördel av forskning om en proteinligand.Dessa strukturer kan också ge insikt i funktionen hos olika proteiner.

Atomer, molekyler och joner kan alla fungera som proteinligander.Ett klassiskt exempel är en antikropp.Antikroppar låses fast på receptorplatser på ytan av proteiner som de som hittade som studerar det yttre kuvertet hos virus.Enzymer och ett antal andra strukturer inuti kroppen använder proteinliganden i deras konstruktion för att möjliggöra olika funktioner.

I vetenskaplig forskning kan människor titta på ett protein för att identifiera potentiella bindnings- eller dockningsställen.Platsen för platser kan ge information om vilken typ av protein det är och vilka funktioner det ska utföra i kroppen.Denna sökning kan också göras omvänd, genom att identifiera ligander och ta reda på vad de potentiellt kan binda till när de cirkulerar genom kroppen.Vissa ligander har ett brett spektrum av verkan och kan ansluta till ett antal olika proteiner, medan andra är extremt exakta.

Läkemedelsutveckling använder proteinligandforskning.Läkemedelsföretag måste identifiera mål på celler och strukturer som virus för att effektivt behandla patienter.Genom att hitta ett protein som är unikt för en viss organisme, till exempel, kan företaget utveckla en proteinligand som kommer att klämma fast på det, bära medicinering för att döda organismen eller stoppa dess reproduktion.Identifiering av målproteiner kan också hjälpa till med utvecklingen av vacciner.

Dessa strukturer kan också vara av intresse för företag som utvecklar laboratorietester.Ett test kan dra nytta av kända ligander och proteiner för att flagga strukturer av intresse i ett prov.Till exempel, om en läkare vill ta reda på om en patient har en virusinfektion, kan laboratoriet introducera ligander med taggar som fluoresce.Om virus finns i provet, är liganderna på och tänds för att visa närvaron av infektion.

Databaser av proteiner och tillhörande ligander finns tillgängliga.Många är fria att använda, i syfte att främja vetenskaplig forskning.Privata databaser som upprätthålls av läkemedelsföretag kan innehålla egen information som används i läkemedelsutvecklingen.I processen att ansöka om patent måste företaget förklara hur ett läkemedel fungerar och detta kan ge information om det använda målet, vilket gör att andra företag kan ta forskningen ytterligare.